週五. 4 月 3rd, 2020

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華南海鮮市場 恐非病毒發源地

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造成這次蔓延全球的新冠肺炎武漢華南海鮮市場,有可能不是病毒發源地!大陸官媒中新社引述中國科學院西雙版納熱帶植物園官方網站消息,該園聯合華南農業大學和北京腦科中心,收集了覆蓋四大洲十二個國家的九十三個新冠病毒樣本基因組數據,通過全基因組數據解析發現,武漢華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其他地方傳入。

報導稱,九十三個樣本包含五十八種單倍型,演化關係顯示,單倍型H13和H38是比較古老的單倍型,通過一個中間載體(mv1,可能是祖先單倍型,也可能是來自中間宿主或零號病人)與蝙蝠冠狀病毒RaTG13關聯,並通過單倍型H3衍生出單倍型H1。

研究人員稱,與華南海鮮市場有關聯的患者樣品單倍型都是H1及其衍生單倍型H2,H8-H12,而一份武漢樣品單倍型H3與華南海鮮市場無關。可見,華南海鮮市場的新冠病毒是從其他地方傳入,再在市場發生快速傳播並蔓延。

另根據病患發病時間紀錄和種群擴張時間推斷,也印證了華南海鮮市場不是病毒發源地的推論。 研究人員對H13和H38的病毒樣品溯源發現,分別來自深圳的病患(廣東首例)和美國華盛頓州的病患(美國首例)。他們的旅行紀錄表明都是去年十二月底至今年一月初在武漢被感染。但現有武漢樣本中沒有檢測到H13和H38單倍型。

研究還顯示,新冠病毒在二月十二日前發生過二次明顯種群擴張:一次是去年十二月八日,該結果暗示病毒可能在十二月初,甚至十一月下旬已開始人際傳播,隨後在華南海鮮市場加快;另一次種群擴張發生在一月六日。

值得一提的是,為細分來源,研究人員將五十八種單倍型分成五組,包括三個古老超級傳播者單倍型(H1,H3和H13)和二個新的超級傳播者單倍型(H56和mv2)。以此鑒別出廣東的病毒可能有三個來源,重慶和台灣的病毒有兩個來源。有較多樣本的澳大利亞、法國、日本和美國,患者感染源至少有兩個,尤其是美國包括了五個來源。

值得關注的是H56這個超級傳播者單倍型,同時是澳大利亞、法國和美國以及台灣患者的傳染源。研究還表明,新冠病毒基因組沒有發生重組事件。

Original: https://udn.com/news/story/120936/4364067

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